Ну на мой взгляд, версия с точными генотипами является доказанной. У караковых генотип будет c аллелью агути: AtAt, Atat. Полностью генотип вроде будет AtAtEE либо AtAtEе, либо
AtatEE, либо AtatEе.
С простой аллелью агути лошадь была бы просто гнедая