Из селекции может и выпадают (селекцию по ним не ведут), а из породы вряд ли. Гены, знаете ли, не всегда поддаются селекции. Но вообще, если то, что Вы написали, правда, это грустно, ибо, если в итоге селекция приведет к сонращению исходного набора генов, ахалтекинцы, наверняка, утратят...